U kuću bogatog švapsa Alvertyja, gdje živi sa sestrom Bridget, bacaju dijete. Squire, koji je prije nekoliko godina izgubio ženu i djecu, odlučuje odgajati dijete kao vlastitog sina. Ubrzo uspijeva pronaći majku nasljednika, siromašnu seosku ženu Jenny Jones. Olverti ne uspijeva saznati od nje ime dječakova oca, no budući da se Jenny pokaje zbog svog čina, vjeverica ne prenosi slučaj na sud, već samo protjera Jenny iz rodnih mjesta, prethodno joj je zajamio veliku svotu. Alverti nastavlja potragu za ocem djeteta. Njegova sumnja pada na seoskog učitelja Partridgea, od kojeg je Jenny dugo vremena pohađala časove latinskog. Na Olvertyjevo inzistiranje, slučaj se vodi na sud. Supruga učitelja, koja je dugo bila ljubomorna na njega zbog Jenny, optužuje svog supruga za sve smrtne grijehe, a nitko ne sumnja da je učitelj otac dječaka. Iako Partridge sam negira njegovu vezu s Jenny, proglašen je krivim, a Alverty ga protera iz sela.
Squirerova sestra, Bridget, udaje se za kapetana Blythea i oni imaju sina. Tom Jones, mladić koji je pobijedio u ljubavi prema Alvertyju, odrastao je s mladom Blythe, ali pohlepni i zavidni kapetan, koji se plaši da će Alvertyjevo bogatstvo otići do mladića, mrzi ga, pokušavajući na bilo koji način ogoliti dječaka u očima svog imenovanog oca. Nakon nekog vremena, kapetan iznenada umre, a Bridget postaje udovica. Od rane dobi, Tom se ne razlikuje u uzornom ponašanju. Za razliku od Blyfila - izvan godina suzdržanog, pobožnog i marljivog - Tom ne pokazuje revnost u svojim studijama i njegova zabluda neprestano uznemirava Alverty i Bridget. Unatoč tome, svi u kući vole mladića zbog njegove ljubaznosti i susretljivosti. Blyfil nikada ne sudjeluje u Tominim igrama, ali osuđuje njegove trikove i ne propušta priliku da se prijavi zbog neprikladnog provoda. Ali Tom se nikad ne ljuti na njega i iskreno voli Blyfila kao brata.
Tom je od djetinjstva prijateljevao sa Sophiom, kćeri susjeda Alvertyja, bogatog zapadnog vjevernika. Provode puno vremena zajedno i postaju nerazdvojni prijatelji.
Za odgoj mladića Alverti poziva teologa Twacoma i filozofa Squire u kuću, koji svojim učenicima postavljaju jedan zahtjev: oni bi trebali bezumno krčiti predavanja i ne imati svoje mišljenje. Od prvih dana Blyfil stječe njihovu simpatiju, budući da pažljivo pamti sve njihove upute. Ali Toma ne zanima ponavljanje zajedničkih istina nakon arogantnih i arogantnih vjeroučitelja i on pronalazi druge aktivnosti za sebe.
Tom provodi svo slobodno vrijeme u kući prosjačkog čuvara, čija obitelj gladuje. Mladić, koliko je to moguće, pokušava pomoći nesretnicima dajući im sav svoj džeparac. Saznavši da je Tom prodao svoju Bibliju i konja, koju mu je poklonio Alverty, i dao novac čuvarskoj obitelji, Blyfil i obojica učitelja bijes su bijesno navalili mladića, smatrajući njegovo djelo dostojnim ukora, dok Alvertyja dodiruje ljubaznost njegove voljene. Postoji još jedan razlog zbog kojeg Tom provodi toliko vremena s obitelji čuvara: zaljubljen je u Molly, jednu od njegovih kćeri. Bezbrižna i neozbiljna djevojčica odmah se upušta u udvaranje, a uskoro njezina obitelj saznaje da je Molly trudna. Ova se poruka odmah distribuira u cijeloj županiji. Sophia Western, koja je dugo voljela Toma, očajna je. On, naviknut da u njoj vidi samo djevojku njegovih igara iz djetinjstva, tek sada primjećuje kako je procvjetala. Nepoznat za sebe, Tom se sve više veže za djevojku, a s vremenom se ta vezanost razvija u ljubav. Tom je duboko nesretan jer shvaća da je sada dužan oženiti Molly. Međutim, stvari polaze neočekivano: Tom hvata Molly u naručju svog učitelja, filozofa Squirea. Nakon nekog vremena, Tom saznaje da Molly uopće nije trudna od njega, te stoga sebe smatra slobodnim od bilo kakvih obaveza prema njoj.
U međuvremenu, Squire Alverty je ozbiljno bolestan. Osjetivši kako se bliži kraj, daje posljednje naredbe o nasljeđivanju. Samo je Tom, koji strastveno voli svog imenovanog oca, neumoljiv, dok su svi ostali, uključujući Blyfil, zabrinuti samo zbog svog udjela u nasljedstvu. Glasnik dolazi u kuću i donosi poruku da je Bridget Alverti, koja je bila nekoliko dana udaljena s imanja, iznenada umrla. Do večeri istog dana vjeverica postaje lakša i on se očito oporavlja. Tom je toliko sretan da čak ni Bridgetina smrt ne može zasjeniti njegovu radost. Želeći proslaviti oporavak imenovanog oca, napije se pijan, što izaziva osudu drugih.
Squire Western želi oženiti svoju kćer Blyfil. To mu se čini izuzetno profitabilnim, budući da je Blyfil nasljednik većine bogatstva Alvertyja. Čak i ne zanima mišljenje njegove kćeri. Western se žuri da od Alvertija dobije pristanak za brak. Već je određen dan vjenčanja, ali Sophia neočekivano za oca mu objavi da nikada neće postati Blyfilova supruga. Ljutiti otac zaključava je u sobi u nadi da će se predomisliti.
U to vrijeme sazrijeva Blyfil, koji je potajno mrzio Toma od djetinjstva, jer se bojao da će većina nasljedstva otići na mladunče, podmukao plan sazrijeva. Zgušnjava, on govori tipiri o Tominovom ponašanju na dan kad je Alverty bio blizu smrti. Budući da su svi sluge bili svjedoci burne zabave naporan Tome, Blyfil uspijeva uvjeriti vjevernika da je Tom sretan zbog njegove skore smrti i da će uskoro postati vlasnik značajnog bogatstva. Vjerujući Blyfilu, ljutit kavalir vozi Tom iz kuće.
Tom piše Sophia oproštajno pismo, shvaćajući da, usprkos strastvenoj ljubavi prema njoj, sada kad je osuđen na lutanje i prosjački život, nema pravo računati s njenom lokacijom i tražiti je za ruku. Tom napušta imanje, namjeravajući otići mornarima. Sophia, očajnički moli svog oca da se ne oženi s mrskim Blyfil, bježi od kuće.
U provincijskom hotelu Tom slučajno susreće Partridgea, istog učitelja kojeg je Alverty jednom poslao iz svog sela smatrajući ga ocem mladunčeta. Partridge uvjerava mladića da je stradao nedužno i traži dopuštenje da prati Toma na njegovim lutanjima.
Na putu za grad Upton, Tom je iz ruku silovatelja spasio ženu, izvjesnu gospođu Waters. U gradskom hotelu gospođa Waters koja se odmah svidjela zgodnom Tomu lako ga zavodi.
U to se vrijeme Sophia, koja se zaputila u London, nadajući se da će naći utočište sa starim prijateljem njihove obitelji, također zaustavila u hotelu Epton i sretna je kad je znala da je Tom među gostima. Međutim, čuvši da ju je prevario, bijesna djevojka, kao znak da zna sve o ponašanju svog ljubavnika, ostavlja rukav u svojoj sobi i ostavlja Uptona u suzama. Srećom slučajnosti u istom je hotelu boravila i Sophijina rođakinja, gospođa Fitzpatrick, koja je pobjegla od muža, negativca i pijavice. Poziva Sophia da se sakrije od svojih progonitelja. U stvari, odmah nakon bijega bjegunaca, ljuti otac Sophia i gospodin Fitzpatrick stižu u hotel.
Ujutro, Tom shvaća zašto ga Sophia nije željela vidjeti, te u očaju napušta hotel, nadajući se da će uspjeti doći do svog dragog i dobiti mu oproštenje.
Sophia pronalazi lady Bellaston u Londonu. Srdačno pozdravlja djevojčicu i, čuvši njenu tužnu priču, obećava joj pomoć.
Tom i Partridge također će uskoro stići u London. Nakon duge potrage, Tom uspijeva napasti trag svog ljubavnika, ali njezin rođak i lady Bellaston sprječavaju ga u susretu sa Sophiom. Lady Bellaston ima svoje razloge za to: unatoč činjenici da je prikladna za Tominu majku, ona se strastveno zaljubljuje u njega i pokušava zavesti mladića. Tom nagađa što dama želi od njega, ali svejedno on ne odbija susret s njom, pa čak i prihvaća novac i poklone od nje, jer nema izbora: prvo, nada se da će otkriti gdje je Sophia, i drugo Nema sredstava za život. Međutim, u vezi s lady Bellaston, Tom uspijeva zadržati distancu. Konačno, Tom slučajno upoznaje svoju voljenu, ali ona, čuvši jamstva vječne ljubavi i vjernosti, odbacuje Tome, jer mu ne može oprostiti izdajstvo. Tom je u očaju.
U kući u kojoj Tom i Partridge iznajmljuju sobu, živi gospodin Nightingale, s kojim se Tom odmah sprijateljio. Nightingale i Nancy - kćerke njihove ljubavnice, gospođe Miller, vole se. Tom od prijatelja saznaje da je Nancy trudna od njega. No Nightingale se ne može oženiti jer se boji svog oca, koji je pronašao bogatu mladenku za njega i koji želi uzeti njegov miraz, inzistira na hitnom vjenčanju. Nightingale se pokorava sudbini i potajno odlazi od gospođe Miller, ostavljajući Nancy pismo u kojem joj objašnjava razloge svog nestanka. Tom od gospođe Miller saznaje da je njezina Nancy, koja strastveno voli Nightingale, primivši oproštajno pismo, već pokušavala da se digne u ruke. Tom odlazi k ocu svog frivolnog prijatelja i najavljuje mu da je već oženjen Nancy. Noćna sestra odustaje od neizbježnosti, a gospođa Miller i njezina kći žurno se pripremaju za vjenčanje. Od sada, Nancy i njezina majka Tome smatraju spasiteljem.
Lady Bellaston, ludo zaljubljena u Toma, neprestano traži sastanke od njega. Shvativši koliko joj duguje. Tom je ne može odbiti. Ali njegovo uznemiravanje ubrzo mu postaje nepodnošljivo. Foundling ponudi svojoj prijateljici pametan plan: on joj mora napisati pismo s ponudom braka. Budući da Lady Bellaston uzima u obzir mišljenje svijeta i ne usuđuje se udati za muškarca koji ima pola njezine dobi, ona će biti prisiljena odbiti Toma, a on će, iskorištavajući to, imati pravo prekinuti sve odnose s njom. Plan uspijeva, ali bijesna dama odluči se osvetiti Tomu.
Sophia, koja i dalje živi u svojoj kući, njeguje bogata lorda Fellamara. On joj daje ponudu, ali prima odbijanje. Ludačka dama Bellaston objašnjava gospodaru da je djevojka zaljubljena u siromašnog lovca; ako gospodar uspije izbaviti svog suparnika, Sophijevo srce bit će slobodno.
Tom posjećuje gospođu Fitzpatrick da razgovara s njom o Sophiji. Napuštajući kuću, susreće svog supruga. Ogorčeni ljubomorni koji je napokon napao trag bjegunaca i otkrio gdje živi, uzima mladića za svog ljubavnika i vrijeđa ga. Tom je prisiljen izvući svoj mač i prihvatiti izazov. Kad padne Fitzpatrick, probijen Tominim mačem, iznenada ih okružuje skupina desetaka dobrih momaka. Hvataju Tome, predaju policajca, a on ide u zatvor. Ispada da je Fellamar poslao nekoliko mornara i naredio im da nađu brod Toma na brodu, dajući im do znanja da se želi riješiti njega, a oni su, uhvativši Toma za vrijeme borbe, kad je ranio protivnika, odlučili samo predati Toma policiji.
Sophin otac, gospodin Western, dolazi u London. Pronalazi svoju kćer i najavljuje joj da će djevojka, dok Alverty i Blyfil stignu, biti u kućnom pritvoru i čekati vjenčanje. Lady Bellaston, odlučivši se osvetiti Tomu, pokazuje Sophiji svoje pismo s ponudom braka. Ubrzo, djevojka saznaje da je Tom optužen za ubojstvo i nalazi se u zatvoru. Alverty stiže s nećakom i zaustavlja se kod gospođe Miller. Olverti je njen dugogodišnji dobročinitelj, uvijek je pomagao siromašnoj ženi kad joj je umro suprug, a ona je ostala bez sredstava s dvoje male djece u naručju. Saznavši da je Tom posvojeni sin vjeverice, gospođa Miller govori mu o plemenitosti mladića. Ali Alverti i dalje vjeruje u klevetu, a pohvale na njemu ne diraju ga.
Nightingale, gospođa Miller i Partridge često posjećuju Tome u zatvoru. Ubrzo mu je došla ista gospođa Waters, ležerna veza s kojom je došlo do neslaganja sa Sophiom. Nakon što je Tom napustio Elton, gospođa Waters tamo je upoznala Fitzpatricka, postala njegova ljubavnica i otišla s njim. Saznavši od Fitzpatricka o nedavnom susretu s Tomom, požurila je posjetiti nesretnog zatvorenika. Tomu je laknulo kad je saznao da je Fitzpatrick siguran i zdrav. Partridge, koji je također došao posjetiti Tome, kaže mu da je žena koja sebe naziva gospođom Waters zapravo Jenny Jones, Tomova majka. Tom je užasnut: sagriješio je s vlastitom majkom. Partridge, koji nikad nije znao zatvoriti usta, kaže Alvertyju o tome, a on je odmah pozvao gospođu Waters na nju. Predstavljajući svom bivšem gospodaru i naučivši od njega da je Tom isto dijete koje je bacila u kuću vjeverica, Jenny napokon odlučuje reći Alvertiju o svemu što zna. Ispada da ni ona ni Partridge nisu uključeni u rođenje djeteta. Tomin otac sin je Alvertyjevog prijatelja, koji je jednom živio u kući vjeverica godinu dana i umro je od malih boginja, a njegova majka nije nitko drugi nego sestra njegova braća, Bridget. U strahu da će osuditi svog brata, Bridget je sakrila od njega da je rodila dijete, a za veliku naknadu uvjerila je Jenny da baci dječaka u njihovu kuću. Stari sluga Alvertyja, čuvši da čučavac zna cijelu istinu, priznaje vlasniku da je Bridget na smrtnoj postelji otkrila njezinu tajnu i napisala bratu pismo koje je predao gospodinu Blyfilu, jer je Alverty u tom trenutku bila bez svijesti. Tek sada Alverty nagađa o Blyfilgovom izdajstvu, koji je, želeći iskoristiti stanje vjeverice, sakrio od njega da su on i Tom braća. Alverty uskoro dobiva pismo bivšeg učitelja dječaka, filozofa Squirea. U njemu on govori kako vjevernik leži blizu smrti i smatra da je njegov dužnost reći mu cijelu istinu. Kvartar, koji nikada nije volio Toma, iskreno se pokaje: znao je da Blyfil griješi Toma, ali, umjesto da izloži Blyfila, radije je šutio. Alverti saznaje da je sam Tom bio neumoljiv kad je šverc bio između života i smrti, a razlog takve neumjesne radosti mladića bio je upravo oporavak njegovog imenovanog oca.
Saznavši cijelu istinu o svom nećaku, Alverti se iskreno pokaje zbog svega što se dogodilo i psuje nezahvalnog Blyfila. Budući da Fitzpatrick nije podigao Tomu nikakvim optužbama, pušten je iz zatvora. Alverti se ispričava Tomu, ali plemeniti Tom ne okrivljuje lignju za ništa.
Nightingale kaže Sophiji da se Tom ne želi oženiti damom Bellaston, jer je on, Nightingale, taj koji je nagovorio Tomu da joj napiše pismo koje je vidjela. Tom dolazi k Sofiji i opet je pita za njezinu ruku. Squire Western, saznavši za Alvertijevu namjeru da Tome učini nasljednikom, rado daje pristanak na njihov brak. Nakon vjenčanja, ljubavnici odlaze na selo i žive sretno daleko od gradske vreve.